Genómica
10/07/12 10:35

Qué es la genómica de la conservación?

  • Artículo: Genomics and the future of conservation genetics
  • Nature Reviews Genetics 11, 697-709 (October 2010)

La genómica de la conservación puede definirse como el uso de técnicas genómicas nuevas para resolver problemas en biología de la conservación. Frankham ha revisado recientemente el estado de la genética de la conservación y ha propuesto 13 prioridades para su desarrollo. Muchas de ellas no se habrían podido abordar con las técnicas tradicionales de la genética. Y aunque las técnicas de la  genómica no son apropiadas o necesarias en todos los casos, creemos que tendrán un papel importante durante los próximos años para abordar varios de los retos que se plantean en investigación.

Estas técnicas podrán aplicarse de forma inmediata a algunas cuestiones. Por ejemplo, en la estimación de parámetros poblacionales neutros como el tamaño efectivo de la población, donde la genómica,  ofrece un mayor número de marcadores para realizar el tipo de análisis y conceptual usado en el ámbito de la genética de la conservación. La identificación de genes funcionalmente importantes se puede utilizar para estudiar la base genética de la adaptación de animales y plantas al entorno y otras cuestiones como la depresión de las poblaciones por efecto de la endogamia.

Por el contrario, poder predecir la viabilidad de una población o la capacidad para adaptarse al cambio climático sobre la base de la información genómica requiere no sólo la identificación de los genes relevantes, sino también una estimación cuantitativa de su relación con su estado de salud y la demografía de dichos seres vivos. Estos desafíos deben ser abordados por la genómica de conservación en el largo plazo.

Comprender los enfoques genómicos es crucial para el éxito de la genómica a la conservación. En la actualidad existe una lista creciente de técnicas para la detección de las diferenicas en el ADN entre individuos --que se aplican habitualmente en el estudio de poblaciones salvajes--, aunque varían ampliamente en la densidad de los marcadores, la posibilidad de dirigir los loci candidatos, el costo por muestra, etc.

Las técnicas genómicas pueden ser agrupadas en tres clases: el marcador basado en genotipos, incluyendo varios basados en plataformas de genotipado de SNP; la secuenciación en representación reducida, que utiliza la nueva generación de la tecnología de secuenciación para llegar a un subconjunto de las regiones ortólogas en el genoma de muchos los individuos; y la secuenciación del genoma completo.

Un componente crucial de todas las técnicas de genómica es la bioinformática. Las herramientas para el manejo de los datos  están cambiando tan rápido como (y en respuesta a) las técnicas para recabarlos. No vamos a revisar el software aquí. Sin embargo, los investigadores que utilizan técnicas de genómica debe planear una inversión sustancial de tiempo y recursos para el almacenamiento de datos y su análisis.

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En vanguardia

Genómica quiere decir vanguardia tecnológica. Tecnología punta y ya no tan cara. El primer paso se dio al leer los cerca de las 3.000 millones de 'letras' que forman el genoma humano. De eso hace diez años y con ello se abrió un nuevo mundo de posibilidades para la biología, la medicina y también a las ciencias que estudian la evolución de las especies.

En una década la evolución exponencial que ha experimentado la tecnología de la genómica ha permitido reducir sustancialmente los costes de secuenciación genética, lo que ha permitido ampliar el abanico de especies analizadas. El genoma del panda fue desentrañado en 2010 y en la actualidad científicos de todo el mundo persiguen el objetivo de secuenciar más de 10.000 especies de vertebrados para estudiar su evolución.

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