Investigación
24/05/12 17:27

Candiles, el lince del genoma

Candiles, el lince del genoma.
Candiles, el lince del genoma.

Es el ejemplar escogido por los científicos como centro de su investigación. Nació en Andujar en 2006 y ahora es un reproductor activo del centro de cría en cautividad de la Olivilla, en Jaén Candiles es un macho de seis años nacido en la población de linces de Andújar (Jaén) en 2006 y en septiembre de ese mismo año pasó a ser uno de los fundadores del programa de conservación ex situ de la especie, teniendo en el Centro de Cría en Cautividad de La Olivilla, también en la provincia de Jaén. Sin saberlo, Candiles se ha convertido en el centro de una investigación nacional que trabaja para secuenciar el genoma de la especie, el primero de un animal que se aborda en España.

¿Para qué servirá poder identificar, colocar en su sitio y leer los tres mil millones de letras que forman el ADN de un lince? Será una potente herramienta tanto para estudiar la evolución y la biología de este felino, el más amenazado del mundo. También permitirá comprender cómo el declive ha afectado a la genética de la especie. Lo que se aprenda servirá para optimizar los esfuerzos que se están haciendo para la conservación de la especie.

La elección de Candiles no fue casual, se prefirió un animal cautivo que está siendo sometido a un seguimiento exhaustivo para observar de aspectos como las posibles enfermedades, su comportamiento u otros aspectos como la reproducción. Además, se buscó un individuo joven y en un nivel medio de consanguinidad, por lo que se prefirió la población de Andújar a la de Doñana, mucho más pobre genéticamente.

En cuanto al sexo, se escogió un macho para que en el genoma estuviera también representado el cromosoma ‘Y’, que no está presente en las hembras (son XX), según explica el coordinador del proyecto, José Antonio Godoy, responsable del grupo de Genética de la Conservación de la Estación Biológica de Doñana. Se trata de un trabajo de dos años en el que están involucrados una treintena de investigadores de seis entidades españolas lideradas por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y que culminarán en 2012 con un genoma completo, que sirva de referencia y esté lo que los científicos llaman ‘anotado’.

El proyecto ha sido financiado por la Fundación General CSIC, en una convocatoria especialmente dedicada a investigaciones de frontera con especies amenazadas (Proyectos Cero: Especies Amenazadas).

El lince será la segunda especie en riesgo de extinción cuyo genoma se analiza, tras la secuenciación del genoma del Oso Panda en 2010. El alto riesgo de su desaparición aumenta la importancia de recopilar y archivar toda la información genética, ya que en el caso de que se extinguiera se contaría al menos con una valiosa información sobre esta especie y una pieza más para comprender cómo las especies evolucionan haciendo que unas se diferencien de otras.

En este sentido, el proyecto forma parte del esfuerzo internacional para recopilar los genomas de los vertebrados terrestres –10.000 especies propuestas-, el Genome 10K Project, que pretende “entender la historia de la vida en el Planeta y qué hace única cada forma de vida”, señala Godoy. De esta forma, en un futuro se podrá saber qué tienen los linces que los diferencien, por ejemplo, de una pantera.

Otros diez linces, un pariente ... y un gato

Pero el trabajo no se termina con Candiles. Su genoma será el de referencia, pero se pretende secuenciar el de otros diez linces más para cotejarlo con él y comprobar la variación que existe entre los distintos linces. Serán seis de Sierra Morena y cuatro de Doñana. De esta última zona se ha decidido analizar a menos individuos debido a su menor diversidad genética (es decir, son todos más parecidos a nivel de ADN). Además, también se secuenciará el genoma del pariente más cercano del lince ibérico: el lince boreal o euroasiático.

En paralelo, otros países están avanzando en la secuenciación genómica de otros felinos, ya hay con qué comparar los genomas de los linces: con el gato doméstico, cuyo genoma fue uno de los primeros genomas animales secuenciados ya en 2007, debido a que es un modelo utilizado en investigación en enfermedades humanas.

La existencia del mapa genético de este pariente relativamente cercano (hace aproximadamente siete millones de años que compartieron un antepasado común) también facilitará el ensamblaje del genoma del lince , que no es otra cosa que ‘poner en orden’ el complicadísimo conjunto de datos que componen el ADN de un ser vivo.

Idiomas disponibles: Inglés
El genoma al completo

El principal objetivo de esta investigación es generar el primer genoma de un lince, que nos brindará una importante información sobre el mecanismo de transmisión de la información genética, la evolución de esta especie, el declive de su diversidad biológica y sus consecuencias.

Las piezas genéticas han sido identificadas en la EBD y mandadas a la CNAG, el organismo responsable de colocarlas en el orden correcto (secuenciación). Cuando se culmine el proceso en 2012 los científicos deberán afrontar un nuevo reto: interpretarlo y compararlo con los genomas de otros felinos.

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